楊燦(朱雨辰 飾)接詩文回家，他想讓詩文成為世界上最幸福最快樂的女人。趁楊燦看孕驗報告書的時候，詩文用手機打字告訴楊燦，沈莉是真的那敏(王力可 飾)，她的犧牲是組織安排的，這一年一直潛伏在BY集團當(dāng)清潔工。楊燦得知這個消息話都說不出來了，那敏沒有犧牲讓他如釋重負。

教授(狄劍清 飾)升級了之前的病毒，只要把這個新病毒放進TPR系統(tǒng)里，就會讓電力系統(tǒng)的TTY防御系統(tǒng)癱瘓。火狐(TAE 飾)不放心楊燦，派了兩個手下跟著去執(zhí)行任務(wù)。

常健安指示利用這次行動甩開敵人，策反教授。

楊燦帶著他的秘書“沈莉”、教授和火狐的兩個手下，五人偽裝成保衛(wèi)部的，混入電力系統(tǒng)機房。教授找到主機，插入閃存等待值入病毒。

衛(wèi)鐵軍(張永達 飾)帶隊進入大樓，混戰(zhàn)中殺死火狐的兩個手下，楊燦挾持衛(wèi)鐵軍走出大樓，開車“逃走”。楊燦擺脫火狐后，帶著教授到約定的地點見到了女兒張玲玲。教授得知了真相。

教授深知只有消滅了綠瑪瑙，他和女兒才能真正的安全。作為綠瑪瑙基金暗夜計劃的技術(shù)總負責(zé)人，教授覺得自己也犯下了不少罪。綠瑪瑙殺害妻子，綁架女兒，還脅迫自己為他們做事，教授覺得不僅為了復(fù)仇，就是為了贖罪也要把綠瑪瑙一網(wǎng)打荊他愿意和特戰(zhàn)隊合作。教授建議借口TTY系統(tǒng)升級，新研制的病毒無法破解，然后引誘綠瑪瑙用自己的主網(wǎng)攻擊目標(biāo)，趁機值入病毒，毀掉他們的系統(tǒng)，獲取他們的內(nèi)部資料，做為他們犯罪的罪證。

綠瑪瑙的會長(馬季 飾)親自來中國督戰(zhàn)?；鸷叭ソ訖C。

林指山(陳逸恒 飾)宣布暗夜計劃實施，病毒開始破解系統(tǒng)。任何知道暗夜計劃的人都不能離開BY集團總部大樓。

陸長風(fēng)(曹克難 飾)做最后的戰(zhàn)前部署。他向大家出示敵人的主犯林指山、藍雪(繆海梅 飾)和火狐。當(dāng)需要特別保護人員的照片中出現(xiàn)楊燦、柳詩文(周庭伊 飾)和那敏時，隊員們都長吁一口氣，原來之前錯怪楊燦了，他和那隊并沒有離開，一直和大家在一起并肩戰(zhàn)斗。得知那敏沒有犧牲，厲劍峰的眼眶紅了。

教授值入的新病毒沒有奏效，因為電力中心升級了TTY防御系統(tǒng)。教授建議用綠瑪瑙基金的主網(wǎng)，強行攻入電力系統(tǒng)內(nèi)部。但這項行動需要得知電力系統(tǒng)的網(wǎng)絡(luò)密碼。會長從火狐那得知林指山的病毒并沒有攻克TPR系統(tǒng)的防御體系，生氣地撤回了資金資助。林指山急于逼楊愛萍說出系統(tǒng)設(shè)置的網(wǎng)絡(luò)密鑰。

詩文肚子痛，林指山安排藍雪送她去醫(yī)院檢查。在醫(yī)院，詩文正好遇到因為勞累過度而送來醫(yī)院的楊愛萍。詩文陪楊愛萍一起回家，發(fā)現(xiàn)林指山正在家里。