1945年日本正式投降，盟軍總司令部和遠東軍事法庭日以繼夜的大規(guī)模搜查和甄別日本戰(zhàn)犯，東京大審判成為戰(zhàn)后最為重要的事件之一。為安全引渡戰(zhàn)犯來華受審，軍委會高參董玉清(修宗迪 飾)被任命為負責該項特大任務的總督察，而與他宿有嫌隙的國防部軍法司司長鐘杞達(白志迪 飾)，則被任命為總指揮。負責安全轉運戰(zhàn)犯資料的馬昀飛(于震 飾)，在運送途中卻突遭恐怖分子襲擊，押送隊員全部陣亡。萬分危急之下，馬昀飛憑著矯健的身手和過人的膽識，從戰(zhàn)火中及時搶救出存有戰(zhàn)犯資料的保險箱。但當董玉清打開保存完好的保險箱時，卻并未發(fā)現(xiàn)那本關鍵的日記本。董玉清授命馬昀飛暗中秘密調查日記本的下落。馬昀飛無疑是此次負責押運戰(zhàn)犯的特勤小組組長的最佳人選。然而，國防部軍法司二處處長白迪夫(鄭強 飾)向鐘杞達秘密報告：關于剿共計劃的629絕密文件失竊，而馬昀飛恰是嫌疑人之一。鐘杞達堅決反對馬昀飛擔任特勤小組組長，而一向把馬昀飛當作心腹的董玉清言辭厲色表明立場——組長非馬昀飛莫屬。日本東京遠東軍事法庭，日本戰(zhàn)犯原K師師長石巖夫(劉文治 飾)(劉文治 飾)正在為他犯下的累累罪行接受正義的審判。為查清日記本的藏匿地點，馬昀飛只身飛往東京，伺機潛入東京帝國檔案館的檔案密室。突然，一黑衣人也偷偷溜進密室，盜取了巢鴉監(jiān)獄結構圖。兩人密室發(fā)生爭斗，無意中按響了警鈴。