宋蓮生(張國立 飾)乃一江湖郎中，浪蕩不羈醫(yī)術高超，在長沙行醫(yī)時巧遇繡莊莊主無雙，被她深深吸引，于是在繡莊門前開起了門診，并應允無雙的請求幫助東林黨購置大量傷藥，違反了朝廷規(guī)定而面臨死罪，由于九芝堂老板的妙計，宋蓮生得以獲救，后來又因此事與地痞齊大頭(李耕 飾)結怨，搶救了聞世堂無能為力的病人，此堂名聲大跌又遭仇視，更因為誤會無雙而離開長沙，地在途中發(fā)現(xiàn)當?shù)佤[瘟疫，疫算將蔓延至長沙，他即刻返回通知九芝堂大量購藥，并控制藥材銷售，瘟疫得以控制，圣上欲賜堂號給立功的藥房，聞世堂吳老太醫(yī)的侄女如月(鄧婕 飾)使出壞招，令九芝堂名聲受損。逢九芝堂藥材短缺，無雙患重病，宋蓮生無奈只得問聞世堂求助，如月又使用計謀令宋蓮生被逐出長沙，無雙亦帶著支離破碎的心前往南京……宋蓮生生性善良、好打抱不平，卻在長沙被迫幾度離返，可謂世事難料，人心叵測……